Memorias del Instituto de Investigaciones en Ciencias de la Salud

COVID-19: Are we close to returning to “normal”?

Social determinants of infant mortality due to reducible causes in counties of northwest of Argentina

RESUMEN Este artículo compara los determinantes sociales de la salud (DSS) entre los departamentos del Noroeste Argentino que poseen alto riesgo de mortalidad infantil neonatal o pos-neonatal reducible y el resto de ellos, entre los años 2010 y 2014. El análisis de las condiciones socioeconómicas y su vínculo con la mortalidad infantil aporta conocimiento necesario respecto a la importancia de la consideración del entorno de las poblaciones y resulta imprescindible para formular políticas públicas adecuadas. Se propone un estudio ecológico con datos censales de 2010 y estadísticas vitales. Se identifican los departamentos de alto riesgo de muerte mediante el software libre SaTScan. Luego, se realiza una prueba T de comparación de medias para muestras independientes. De esta forma, se identificaron mayores deficiencias en los DSS de las zonas con alto riesgo.

ABSTRACT We aim to compare the social determinants of health (DSS) between the departments of the Argentine Northwest with a high risk of reducible neonatal and postneonatal infant mortality and the rest of them, between 2010 and 2014. Consideration of socioeconomic conditions and their link with infant mortality provides essential knowledge regarding the importance of considering the environment of populations and is essential for formulating adequate public policies. An ecological study is proposed, with census data from 2010, and vital statistics. Departments at high risk of death are identified using free Satscan software, and then a mean comparison t-test is performed for independent samples. Greater deficiencies were identified in the DSS in high-risk areas.

Clinical and demographic characteristics of patients with irreversible blindness at the General Ophthalmology Service of the "Clínica Belén", Coronel Oviedo, Paraguay from February 2018 to February 2019

RESUMEN Según la Organización Mundial de la Salud, la ceguera está definida como la agudeza visual inferior a 3/60 (20/400) en el mejor ojo y un campo visual menor a 10° desde el punto central de fijación. El objetivo de este trabajo fue describir las características clínico demográficas de pacientes con diagnóstico de ceguera irreversible atendidos en el Servicio de Oftalmología General de la Clínica Belén - Coronel Oviedo (Paraguay). Estudio observacional, descriptivo y retrospectivo de corte transversal. Se realizó la revisión retrospectiva de las historias clínicas de los pacientes con diagnóstico de ceguera irreversible atendidos en el Servicio de Oftalmología General de la Clínica Belén, entre el 1 de febrero 2018 y el 28 de febrero 2019. Se analizaron la edad, sexo, escolaridad, procedencia, agudeza visual, comorbilidades y etiología de la deficiencia visual. El análisis estadístico fue mediante el cálculo de frecuencias absolutas y relativas para las variables cualitativas, y el promedio y desviación estándar para las cuantitativas. Se estudiaron 78 pacientes, con predominio del sexo masculino (56,4%), edad de 71 a 95 años (43,6%) y primaria incompleta (41%). La hipertensión arterial (55,6%) fue la principal comorbilidad y glaucoma (43,6%) la etiología de ceguera más frecuente. El glaucoma fue más frecuente en varones que en mujeres (59% vs 32%) y en pacientes mayores de 50 años de edad (50%). En esta serie, los pacientes presentaron ceguera irreversible bilateral, en mayor frecuencia en varones, mayores de 50 años de edad, hipertensión como comorbilidad y glaucoma como etiología más frecuente.

ABSTRACT According to the World Health Organization, blindness is defined as visual acuity less than 3/60 (20/400) in the better eye and a visual field less than 10 ° from the central fixation point. The objective was to describe the clinical demographic characteristics of patients with a diagnosis of irreversible blindness treated at the General Ophthalmology Service of the "Clínica Belén" - "Coronel Oviedo" (Paraguay). This was an observational, descriptive and retrospective cross-sectional study. A retrospective review of the medical records of patients with a diagnosis of irreversible blindness treated at the General Ophthalmology Service of the "Clínica Belén" between February 1, 2018 and February 28, 2019 was carried out. Age, sex, education, origin, visual acuity, comorbidities and etiology of visual impairment were analyzed. The statistical analysis was through the calculation of absolute and relative frequencies, as well as the average and standard deviation. Seventy eight patients were studied, with a slight predominance of males (56.4%), aged 71 to 95 years (43.6%), incomplete primary school (41%) and from "Coronel Oviedo" (25.6 %) and surroundings. Arterial hypertension (55.6%) was the main comorbidity and glaucoma (43.6%) the most frequent blindness etiology. Glaucoma was more common in male patients than female patients (59% and 32%, respectively) and in patients older than 50 years of age (50%). In this series, patients presented bilateral irreversible blindness, more frequent in men, older than 50 years of age, hypertension as comorbidity and glaucoma as the most frequent etiology.

Implementation of a flavivirus detection system in mosquitoes

RESUMEN Los Flavivirus constituyen virus transmitidos por artrópodos, principalmente mosquitos. Pueden producir enfermedades en humanos y animales, también incluyen virus específicos de insectos que solo infectan y se replican en los insectos, no así en vertebrados. En Paraguay los virus dengue, fiebre amarilla y Zika fueron detectados en infecciones humanas, pero los estudios de flavivirus en mosquitos son aún escasos. Por ello, el objetivo del presente estudio fue implementar un sistema de detección de flavivirus en mosquitos en el IICS-UNA. Primero, se organizaron capacitaciones en colecta, preparación de pools y procesamiento por técnicas de RT-PCRs convencionales realizadas por expertos internacionales a profesionales locales (bioquímicos y biólogos). Además, se implementaron planillas de registro de datos y de control de transporte de muestras de los lugares de colectas hasta el IICS-UNA. Se prepararon en total 201 pools de 1 a 35 mosquitos cada uno agrupados por especie, localidad, entre otros criterios. Para asegurar la integridad del RNA extraído se realizó la detección de un control interno (Actina-1), siendo todos los pools positivos para el mismo, 91/201 pools fueron positivos para flavivirus. Se realizó la secuenciación de 19/91 pools positivos para flavivirus identificándose flavivirus de insectos (detectándose principalmente Culex Flavivirus, cell fusing agents Flavivirus y Kamiti river virus), evidenciando la elevada distribución de estos virus. Estos resultados demuestran que fue factible implementar el sistema de detección de flavivirus en mosquitos, lo cual podría contribuir a fortalecer la vigilancia y control de estas virosis, así como el conocimiento sobre la importancia ecológica de flavivirus de insectos.

ABSTRACT Flaviviruses are viruses transmitted by arthropods, mainly mosquitoes. They can cause diseases in humans and animals, they also include specific insect viruses that only infect and replicate in insects, not in vertebrates. In Paraguay, dengue, yellow fever, and Zika viruses were detected in human infections, but studies of flaviviruses in mosquitoes are still scarce. Therefore, the objective of the present study was the implementation of a flavivirus detection system in mosquitoes at IICS-UNA. First, trainings on collection, pool preparation and processing by conventional RT-PCR techniques were organized by international experts for local professionals (biochemists and biologists). In addition, data log sheets and sample transport control forms from the collection sites to the IICS were implemented. A total of 201 pools of 1 to 35 mosquitoes were prepared, each grouped by species, locality, among others. To ensure the integrity of the extracted RNA, an internal control (Actin-1) detection was performed, all pools being positive for it; 91/201 pools were positive for flaviviruses. The sequencing of 19/91 pools positive for flavivirus was carried out, identifying flavivirus in all cases of insects (mainly detecting Culex Flavivirus, cell fusing agents Flavivirus and Kamiti river virus), evidencing the high distribution of these viruses. These results demonstrate that it was feasible to implement the flavivirus detection system in mosquitoes, which could contribute to strengthen the detection, surveillance and control of these viruses, as well as, the knowledge about the ecological importance of insect flaviviruses.

Detection of human papillomavirus in oral mucosa in men with anogenital warts

RESUMEN El virus del papiloma humano (HPV) es el agente etiológico de infecciones de transmisión sexual relacionadas con procesos oncogénicos genitales y orales. La biología molecular, mediante la identificación de los tipos virales involucrados, proporciona precisión diagnóstica con un enfoque epidemiológico. El objetivo de este estudio fue determinar la presencia de HPV en la mucosa oral de hombres con verrugas anogenitales y correlacionar los genotipos detectados en ambas muestras. Se estudiaron 26 pacientes varones con verrugas anogenitales que acudieron al Instituto de Dermatología de la ciudad de Resistencia (Argentina). La presencia de HPV en muestras orales y anogenitales se estudió mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y la genotipificación se realizó mediante PCR-RFLP. La prevalencia de HPV oral en pacientes con HPV anogenital fue del 46,2% (12/26). Se encontraron dieciocho genotipos con alto riesgo oncogénico en muestras orales de pacientes con infecciones únicas o múltiples y el tipo 16 fue el más frecuente (6 pacientes). Catorce genotipos en muestras orales fueron de bajo riesgo oncogénico, el más frecuente fue el tipo 6 (10 pacientes). En muestras anogenitales el genotipo 6 fue el más frecuente (13 pacientes), solo o en coinfección. Se encontró una alta prevalencia de HPV oral de malignidad de alto grado en nuestra población y coinfección con tipos oncogénicos. Las prácticas de sexo oral fueron la principal conducta de riesgo para la infección, lo que quedó demostrado por el hallazgo simultáneo del mismo tipo de HPV en muestras orales y anogenitales.

ABSTRACT The human papillomavirus (HPV) is the etiologic agent of sexually transmitted infections related to genital and oral oncogenic processes. Molecular biology provides accurate diagnosis with an epidemiological approach, by identifying the viral types involved. The objective of this study was to determine the presence of HPV in oral mucosa from men with anogenital warts and to correlate the genotypes detected in both samples. Twenty-six male patients suffering anogenital warts who attended to the Institute of Dermatology in Resistencia (Argentina) were studied. The presence of HPV in oral and anogenital samples was studied by PCR and genotyping was performed by PCR-RFLP. The prevalence of oral HPV in patients with anogenital HPV was 46.2% (12/26). Eighteen genotypes with high oncogenic risk were found in oral samples of patients with single or multiple infections and type 16 was the most frequent (6 patients). Fourteen genotypes in oral samples were of low oncogenic risk and the most frequent was type 6 (10 patients). In anogenital samples the genotype 6 was the most frequent (13 patients), alone or in co-infection. A high prevalence of high-grade malignancy oral HPV in our population and co-infection with oncogenic types were found. Oral sex practices were the main risk factor for infection, which was demonstrated by the simultaneous finding of the same HPV type in oral and anogenital samples.

Molecular characterization of carbapenemases in Gram-negative bacilli circulating in hospitals of Paraguay. First quarter of 2021.

RESUMEN La resistencia a los antimicrobianos (RAM), representa un grave problema por el uso indiscriminado de antimicrobianos de amplio espectro. En nuestro país, durante el primer cuatrimestre del año, se observó un aumento inusual en el número de aislamiento de gérmenes multirresistentes, sobre todo de bacilos gramnegativos, los cuales fueron remitidos al laboratorio de referencia con el objetivo de caracterizar los genes de resistencia a los carbapenemes. Estudio observacional y prospectivo de corte transversal en 456 aislamientos de bacilos gramnegativos provenientes de 11 centros colaboradores de la Red Nacional de Vigilancia de la RAM, remitidos al Laboratorio Central de Salud Pública entre enero y abril de 2021, para la detección molecular (reacción en cadena de la polimerasa múltiple) de los genes de resistencia enzimática bla OXA-51, bla OXA-23, bla OXA-24, bla OXA-48, bla OXA-58, bla NDM, bla KPC, bla IMP, bla VIM. Trescientos sesenta correspondieron a bacilos gramnegativos no fermentadores: 346 Acinetobacter baumannii y 14 Pseudomonas aeruginosa; 96 fueron miembros de Enterobacterales, siendo prevalente Klebsiella pneumoniae (81). Todos los aislamientos de Acinetobacter baumannii resultaron ser productores de carbapenemasas: OXA-23 (94%), NDM (4%), NMD+OXA-58 (2%); en Pseudomonas aeruginosa, 7 de los 14 aislamientos (50%) fueron portadores de metalobetalactamasa del genotipo NDM (100%). Los genotipos NDM (92%) y KPC (8%) fueron confirmados en Enterobacterales. La resistencia plasmídica a carbapenemes es endémica en nuestro país, siendo prevalentes los genotipos OXA-23 en Acinetobacter baumannii y NDM en Pseudomonas aeruginosa y Enterobacterales.

ABSTRACT Antimicrobial resistance (AMR) represents a serious problem due to the indiscriminate use of broad-spectrum antimicrobials. During the first quarter of the year, an unusual increase in the number of isolation multi-resistant germs, especially gram-negative bacilli was observed, specially of Gram-negative bacilli which were referred to the reference laboratory in order to characterize the carbapenems resistance genes. Observational and prospective cross-sectional study in 456 isolates of Gram-negative bacilli from 11 collaborating centers of the National AMR Surveillance Network, referred to the Central Public Health Laboratory (LCSP) between January and April 2021, for molecular detection (multiple polymerase chain reaction) targeting the enzymatic resistance genes: bla OXA-51, bla OXA-23, bla OXA-24, bla OXA-48, bla OXA-58, bla NDM, bla KPC, bla IMP, bla VIM. Of the 456 isolates studied, 360 corresponded to non-fermenting Gram-negative bacilli, of which 346 were confirmed as Acinetobacter baumannii and 14 Pseudomonas aeruginosa; 96 were Enterobacterales, being Klebsiella pneumoniae (81) the most prevalent. All isolates of Acinetobacter baumannii carried genes encoding carbapenemases, being the OXA-23 (94%) followed by NDM (4%) and NDM +OXA-58 (2%). In Pseudomonas aeruginosa strains, 7 of the 14 isolates (50%) were carriers of NDM metallobetalactamase (100%). No carbapenemase gene was detected in the remaining 7. In all Enterobacterales strains, the presence of carbapenemases of the NDM (92%) and KPC (8%) genotypes were confirmed. Plasmid resistance to carbapenems is endemic in our country, being the OXA-23 genotypes prevalent in Acinetobacter baumannii and NDM in Pseudomonas aeruginosa and Enterobacterales.

Knowledge, attitudes, practices and perception of risk of dairy herd workers in Colonia 07 Montes regarding specific zoonoses

RESUMEN Los trabajadores de hatos lecheros están en constante riesgo de contraer enfermedades zoonóticas como la brucelosis, tuberculosis, leptospirosis y carbunco bacteridiano, por la exposición a agentes biológicos y el contacto directo con animales durante el desarrollo de sus labores. Se describe el nivel de conocimientos, actitudes, prácticas, percepción de riesgo y las características sociodemográficas de los trabajadores de hatos lecheros de la colonia 07 Montes del distrito de Curuguaty, frente a las zoonosis, en el último trimestre del 2019. Fue un estudio cuantitativo, observacional, descriptivo, de corte transversal en el cual se utilizó un cuestionario con 33 preguntas aplicado a 121 trabajadores, con el que se recogieron variables demográficas, conocimientos, actitudes, prácticas y percepción de riesgo. Los datos se analizaron a través del programa estadístico SPSS. Para el análisis univariado, se empleó la estadística descriptiva para representar los datos expresados en frecuencias, porcentajes y tablas. El 52,9 % de los trabajadores tenía conocimiento sobre la brucelosis, tuberculosis y leptospirosis, el 74,4 % tenía actitudes positivas, el 66,9% implementaba prácticas positivas y el 52,9% percibía el riesgo. Menos del 75% de los trabajadores encuestados tenían conocimientos, actitudes, prácticas y percepciones de riesgo óptimos, lo que resulta preocupante considerando la exposición constante de los mismos a las enfermedades zoonóticas, es por ello que se deberían implementar estrategias educativas de carácter multisectorial concernientes a estas patologías y sus medidas preventivas a modo de mejorar esta situación.

ABSTRACT Dairy herd workers are at constant risk of contracting zoonotic diseases such as brucellosis, tuberculosis, leptospirosis and anthrax, due to exposure to biological agents and direct contact with animals during the performance of their work. The level of knowledge, attitudes, practices, risk perception and sociodemographic characteristics of dairy herd workers in the 07 Montes colony of the Curuguaty district against zoonosis was described in the last trimester of 2019. A quantitative, observational study, descriptive, cross-sectional, in which a questionnaire with 33 questions applied to 121 workers was used, with which demographic variables, knowledge, attitudes, practices and risk perception were collected. The data were analyzed through the SPSS statistical program. For the univariate analysis, descriptive statistics were used to represent the data expressed in frequencies, percentages and tables. It was observed that 52.9% of the workers had knowledge about zoonotic diseases, 74.4% had positive attitudes, 66.9% implemented positive practices and 52.9% perceived the risk. Less than 75% of the workers surveyed had optimal knowledge, attitudes, practices and perceptions of risk, which is worrying considering their constant exposure to zoonotic diseases, that is why multisectoral educational strategies should be implemented concerning these pathologies and their preventive measures to improve this situation.

Epidemiology of COVID cases - 19 diagnosed in sanitary shelters in greater Asunción, Paraguay (2020)

RESUMEN Paraguay habilitó albergues sanitarios para que guarden cuarentena las personas venidas del exterior, como medida para evitar la propagación de casos de COVI-19. El objetivo fue describir las características epidemiológicas de los casos de COVID-19 diagnosticados en los albergues sanitarios en el Gran Asunción desde el 7 de marzo al 30 de setiembre. Estudio descriptivo, transversal, temporalmente retrospectivo. El muestreo fue no probabilístico de casos consecutivos. Las variables de los casos confirmados fueron, sexo, edad y distritos. Fueron utilizados datos de acceso abierto del Ministerio de Salud Pública y Bienestar Social. Para análisis estadístico de las variables fueron incluidas frecuencias, expresadas como porcentajes, para lo cual fue utilizado el programa Excel. Se diagnosticaron 390 casos en el Gran Asunción. El mayor número de casos se registró en agosto (118 casos). El 69,2% (270) de los casos en el Gran Asunción fue del sexo masculino, relación hombre/mujer de 2,3. El 34,9% (136) tenía edades entre 20 a 29 años, (promedio 33.8±16,14, IC95% 2,2- 65,5). El 80% (310) del total se presentó en menores de 50 años. Las ciudades con mayor cantidad de casos fueron Asunción (46,2%, 180) y los Distritos de Luque (8,7%, 34); Ñemby (6,4%, 25) y Capiatá (5,1%,20). Las características epidemiológicas presentadas son las esperadas, dado el perfil sociodemográfico de estas ciudades.

ABSTRACT Paraguay opened sanitary shelters to quarantine people arriving from abroad, as a measure to prevent the spread of COVID-19 cases. The objective was to describe the epidemiological characteristics of COVID-19 cases diagnosed in sanitary shelters in Greater Asunción from March 7 to September 30. It was a descriptive, cross-sectional, temporally retrospective study, with non - probabilistic sampling of consecutive cases. The variables of confirmed cases in quarantine facilities were sex, age and departments. Open access data from the Ministry of Public Health and Social Welfare were used. For statistical analysis of the variables, frequencies, expressed as percentages, were included and the Excel program was used for it. Three hundred and ninety cases were diagnosed in Greater Asunción. The highest number of cases was in August (118 cases), 69.2% (270) of the cases in Greater Asunción were male, with a male/female ratio of 2.3, 34.9% (136) ranged from 20 to 29 years old, (mean 33.8 ±16.14, 95% CI 2.2-65.5). Eighty percent (310) of the cases occurred in the population under 50 years of age. The locations that presented the highest number of cases were Asunción (46.2%, 180) and the Districts of Luque (8.7%, 34); Ñemby (6.4%, 25) and Capiatá (5.1%, 20). The epidemiological characteristics presented were expected given the socio demographic profile of these cities.

Clinical and demographic characteristics, and access to gluten free products of patients with celiac disease registered in the FUPACEL

RESUMEN La enfermedad celíaca (EC) es una enfermedad inflamatoria autoinmune que afecta la mucosa del intestino delgado que lleva a un estado de mal absorción en pacientes genéticamente susceptibles desencadenada por la ingesta de gluten. Tiene síntomas inespecíficos, complicaciones asociadas y no existe a nivel nacional una ley de apoyo económico para las personas con dificultad para seguir una dieta libre de gluten. El objetivo de este estudio observacional, descriptivo, de corte transversal fue describir las características clínicas, demográficas y acceso a productos sin gluten de 237 pacientes con enfermedad celíaca registrados en la Fundación Paraguaya de Celiacos (FUPACEL) en el 2020 y que aceptaron responder una encuesta en línea publicada en la página oficial de la FUPACEL. El 70,4% de los participantes era del sexo femenino, la edad de diagnóstico fue en el 34,5% entre 20-30 años, 48 % tenía algún familiar con EC, el 69,1% presentó distensión abdominal como sintomatología inicial, 16,8% presentó hipotiroidismo como patología asociada, y 42% fue hospitalizado al menos una vez. El 82,7% de los encuestados respondió que la dieta era suficiente como tratamiento, 48% tenía un trabajo y podía solventar los gastos, sin embargo, el 79,3% opinó tener acceso limitado a los productos sin gluten, el 92% que los alimentos sin gluten eran costosos y que se necesitaba una ley de apoyo económico para solventar los gastos. La mayoría reconoció que la dieta sin gluten como tratamiento era suficiente, sin embargo, por su alto costo se necesita una ley de apoyo económico para las personas con enfermedad celiaca.

ABSTRACT Celiac disease (CD) is an autoimmune inflammatory disease that affects the mucosa of the small intestine that leads to a state of malabsorption in genetically susceptible patients triggered by the ingestion of gluten. It has nonspecific symptoms, associated complications, and there is no national financial support law for people with difficulty following a gluten-free diet. The objective of this observational, descriptive, cross-sectional study was to describe the clinical, demographic characteristics and access to gluten-free products of 237 patients with celiac disease registered in the FUPACEL in 2020 who accepted to answer a online survey published in the official FUPACEL webpage. Seventy-point four percent of the patients were female, their age of diagnosis was between 20-30 years in 34.5%, 48% had relatives with CD, 69.1% presented abdominal distension as initial symptoms, hypothyroidism was present in 16.8% as associated pathology, and 42% were hospitalized at least once. Eighty-two-point seven percent of those surveyed answered that diet was sufficient as a treatment, 48% had a job and could afford expenses, however, 79.3% said they had limited access to gluten-free products, 92% that gluten-free foods were expensive and a financial support law was needed to cover the costs. Most recognized that a gluten-free diet as a treatment was sufficient, however, due to its high cost, a law of financial support is needed for people with celiac disease.